Mikroinjeksiyon (ICSI) yönteminde ise; hem aşılamada hem de klasik tüp bebek
yönteminde belirli miktarın üzerinde sperm olması gereklidir. Ancak erkeğe bağlı
birçok üreme bozukluğunda sperm sayısı çok azdır. Hatta testisten alınması gerekmektedir. Böyle durumlarda, sperm hücresinin bir tanesi mikroskobik enjektör yardımıyla yumurta içine bırakılmakta, böylece döllenme sağlanmaktadır. Bu uygulamaya mikroinjeksiyon adı verilmektedir