Bilim, Sanayi ve Teknoloji Bakanlığın ana hizmet birimleri şunlardır;
a. Sanayi Genel Müdürlüğü.
b. Bilim ve Teknoloji Genel Müdürlüğü.
c. Sanayi Bölgeleri Genel Müdürlüğü.
ç. Metroloji ve Standardizasyon Genel Müdürlüğü.
d. Sanayi Ürünleri Güvenliği ve Denetimi Genel Müdürlüğü.
e. Verimlilik Genel Müdürlüğü.
f. Avrupa Birliği ve Dış İlişkiler Genel Müdürlüğü.
g. Rehberlik ve Teftiş Başkanlığı.
ğ. Strateji Geliştirme Başkanlığı.
h. Hukuk Müşavirliği.
ı. Personel Dairesi Başkanlığı.
i. Destek Hizmetleri Dairesi Başkanlığı.
j. Bilgi İşlem Dairesi Başkanlığı.
k. Basın ve Halkla İlişkiler Müşavirliği.
l. Özel Kalem Müdürlüğü