Özbek muhalif lideri Muhammed Salih’in Türkiye’ye sığınması, Özbekistan’la olan ilişkilerin soğumasında önemli bir etken oldu. 1999’da Kerimov’a Taşkent’te yapılan suikast teşebbüsü ise Türk-Özbek ilişkilerinde bir kırılma noktası oldu. Bu olayın sorumlusu olarak görülen muhalif liderin Özbekistan’a iade edilmemesi, Türkiye’ye karşı kırgınlık ve küskünlüğe sebep oldu.