Katılım Ortaklığının öncelikleri ve mevzuatın yaklaştırılması konularındaki gelişmeyi izlemek amacıyla, aday ülkelerin Ortaklık Komitelerine bağlı alt komiteler kurulmuştur.

Alt komitelerin karar alma yetkisi yoktur. Söz konusu 8 alt komite şu şekilde sıralanabilir:

Tarım ve Balıkçılık
• İç Pazar ve Rekabet
• Ticaret, Sanayi ve AKÇT Ürünleri
• Ekonomik ve Parasal Konular, Sermaye Hareketleri ve İstatistik
• Yenilikçilik
• Ulaştırma, Çevre ve Enerji (Trans-Avrupa Ağlarını da içermek üzere)
• Bölgesel Kalkınma, İstihdam ve Sosyal Politika
• Gümrükler, Vergilendirme, Uyuşturucu Kaçakçılığı ve Kara Para Aklama