Türkiye ile AB arasındaki ortaklığın geliştirilmesi ve yönetilmesi amacıyla bir organizasyon yapısının oluşturulması kararlaştırılmıştır. Bu kapsamda oluşturulan ortaklık organları şunlardır:
• Ortaklık Konseyi
• Ortaklık Komitesi
• Karma Parlamento Komisyonu
• Karma İstişare Komitesi
• Gümrük İşbirliği Komitesi
• Gümrük Birliği Ortak Komitesi