ŞİÖ, ilk olarak 1996 yılında Çin’in insiyatifi doğrultusunda Türkmenistan hariç Orta Asya bölgesini içine alan, Rusya Federasyonu, Kırgızistan, Tacikistan ve Kazakistan tarafından, üye ülkeler arasında “Şanhay Beşlisi” adıyla kurulmuştur.

2001 yılında ise Özbekistan’ın da üye olmasıyla bütünlüğünü tamamlamıştır.

Merkezî Pekin’dedir.