Muhasebe Modülü, Gümrük İdaresi Muhasebe Memurları ve Saymanlık Veznedarları tarafından kullanılabilen modüldür. Muhasebe Modülü kapsamında tahsilat ve ödeme işlemleri, vezne ve menkul kıymet alındıları, tahsilat bordrosu ve kasa işlemleri gibi işlemler gerçekleştirilmektedir. Bankalara yatan kesin tahakkukların dekontlarının düzenlenmesi, transit işlemlerinde memur refakati ile giden eşyada teminatın kaldırılması işlemleri, gümrük idaresi yetkilileri tarafından gerçekleştirilmektedir. Nakit tahsilatlar (nakit teminatlar dahil), menkul kıymetler (banka mektubu ve benzeri kıymetli evrakların teslim alınması) ve diğer genel muhasebe modülü işlemleri Saymanlık Veznedarı tarafından gerçekleştirilir. BİLGE birbiriyle entegre çalışan modüllerden oluşmuştur.