Gümrük işlemlerinde  BİLGE Sistemi dahilinde gerçekleştirilmesinden sağlanan genel avantajları,  hızlı özet beyanı, detaylı beyan imkanı, transit beyan imkanı, risk analizi imkanı vermektedir.

Gümrük mevzuatı ve rejimleri doğrultusunda gümrük işlemlerinin hızlı, doğru ve zamanında uygulanması, gümrük işlemlerini daha hızlı gerçekleştirerek ihracatçıların rekabet gücünün artırılması, personelin daha etkin kullanılarak verimliliklerinin artırılması, dış ticaret istatistiklerinin daha hızlı, doğru ve güvenli olarak üretilmesi, daha etkili vergi tahsilatı, seçici, ancak daha etkili gümrük kontrolünü sağlanması amaçlanmaktadır.

Gümrük işlemlerinde, Bilge Sistemi kurulması sonucunda, Avrupaya entgre imkanı, kotaların entegresi, işlem prosedürlerinin tanımlanması ve tarifeler sistemidir.

Gümrük işlemlerinde, Bilge Sistemi kurulması sonucunda, tranist takip sistemi, dış ticaretin kontrol etme, kontenyerları gözetlemek ve yolcu işlemleridir.

Gümrük işlemlerinde, Bilge Sistemi kurulması sonucunda elde edilen avantajlar, veri ambarı işletimi, kaçak bilgi bankası kurulması ve referans tablolarıdır.