Topraktaki kirletcilerin mikrobiyolojik olarak giderilmesinde toprağın nem içeriği, pH değeri, sıcaklık ve mikrobiyolojik yapısı önemlidir. Bu tür parametrelere bağlı olarak mikroorganizmalar, topraktaki kimyasal kirleticilerin biyodegradasyonunu sağlarlar. Dekontaminasyon yöntemleri içinde çevresel açıdan en kabul edilebilir teknik mikroorganizmalar yoluyla gerçekleştirilen biyodegredasyon yöntemidir. Bu yöntem biyoremedisyon olarak adlandırılır.