Güvenlik sistemleri sadece raftan satın alınıp kullanılacak bir ürün, teknik, yazılım veya donanım teknolojisi değildir. Aynı zamanda işletmenin tüm birimlerini ve yönetim anlayışını etkileyecek bir sistemdir. E-ticaret işletmesine yönelik güvenlik tehditlerinin yüzde yüz önlenebilmesi olanaksız olmakla birlikte, işletmelerin bunu en aza indirecek önlemleri alması ve sürekli güncellemesi gerekmektedir. Bu amaçla güvenlik önleme araçları dört temel başlıkta sınıflandırılmaktadır. Bunlar:
İnternet iletişiminin korunması
İletişim kanallarının korunması
Ağların korunması
Sunucu ve istemci korunması