Biyolojik savaş birçok avantaja sahiptir. Doğal dengeyi korur, çevre ve insan sağlığına olumsuz etkisi yoktur. Dayanıklılık sorunları yoktur ve süreklidirler. Hatta bu nedenle başlangıç riski diğer savaş yöntemlerinden daha ekonomiktir. Bu avantajlarının yanında biyolojik savaş çalışmaları zaman gerektirir, zaman alıcıdır.  Doğal düşman popülasyonunun zararlı üzerinde baskı kurabilmesi, yani denge durumu için belli bir sürenin geçmesi gerekir. Bu süre içindeki bir miktar zarara da katlanılması gerekir.