Bakteriler doğada toprak, su, hava, bitki, insan,
hayvan, gıda, yem gibi her türlü ortamda bulunur
ve gelişirler. Çeşitli maddelerin üretilmesinde ve
doğada madde çevriminde rol oynarlar. Bir kısmı
atmosferik azotu tesbit etme özelliğine sahiptirler.
Atmosferik azotu amonyağa çevirerek amino asit ve
proteinleri üretmek üzere organik asitlere dönüştürülebilirler. Tarımda biyolojik mücadelede önemli
rolleri bulunmaktadır. Atık su arıtılmasında, peynir, yoğurt, turşu, sirke gibi çeşitli gıdaların ve antibiyotiklerin üretilmesinde önemli bir rol oynarlar. Petrol kirliliği nedeni olan hidrokarbonlar ve
organik kirleticiler gibi çevre kirliliğine neden olan
maddelerin parçalanmasında aktif olarak iş görürler. Ayrıca doğada kolayca parçalabilen biyoplastiklerin üretilmesinde bakterilerden yararlanılmaktadır. Tedavi amaçlı insülin, büyüme faktörleri gibi
proteinlerin üretilmesinde biyoteknolojik olarak
yararlanılmaktadır. Hızlı çoğalmaları nedeniyle
bakteriler genetik ve moleküler biyoloji çalışmalarında kullanılırlar. Arkea’nın enzimlerinden biyoteknolojik amaçlı yararlanılmaktadır.