Çekirdeksiz prokaryotlar, ilk olarak gelişen hücre formudur.

Ribozom, kloroplast, hareket organelleri gibi yapıların hücreye dışarıdan girerek ökaryot hücreleri oluşturdukları düşünülmektedir.

Çekirdekli hücreler adım adım evrimleşerek organizasyonlarını geliştirmişlerdir.

İlkin hücrenin etrafı yarı geçirgen bir zarla çevriliydi ve içinde yalnızca kalıtsal materyal taşımaktaydı.

Çekirdeğin yaklaşık olarak 2.5-3 milyar yıl önce ortaya çıktığı tahmin edilmektedir.