Cryptosporidium infeksiyonları daha çok gelişmekte olan ülkelerde özellikle beş yaşından küçük çocuklarda görülür. İnfeksiyon, parazitin canlı ookistlerinin sindirim sistemi yoluyla alınmasıyla ortaya çıkar. Canlı ookistlerin mide ve duodenumda sindirimini takiben her bir ookistten dört sporozoit meydana gelir ve epitel hücrelerine yayılarak tropozoitlere dönüşür. Tropozoitler epitel hücresi içinde çoğalır ve insanda infeksiyon oluşturur.