Profilleme, havacılık güvenliğinin sürekliliğini, yani toplumlar tarafından kabulünü sağlama adına çeşitli açılardan eleştirilmesine karşın, başta ABD olmak üzere diğer birçok gelişmiş ülkede uygulama alanı bulmaktadır. Sistem konusundaki en yaygın eleştiri, veri tabanına göre risksiz bulunan yolculara pozitif ayrımcılık yapıldığı, bu nedenle güvenlik sorunlarının yaşanabileceği yönündedir. Bir diğer eleştiri ise adi suçlar ya da kötü finansal kayıt gibi havacılık güvenliğine olumsuz etkileri olamayacak bireylerin de riskli olarak değerlendirilmesine yöneliktir. Temelde profilleme, veri tabanına göre karar verilmesine dayandırılarak ırka dayalı önyargıları engellemeyi amaçlamaktadır.