Su kirliliği ile değişik niteliklere göre değişik sınıflamalar yapılmaktadır. Bunlardan bazıları şunlardır:
1. Alıcı Ortama Göre Su Kirliliği:
-Yeraltı Su Kirliliği: Doğal Kaynak Sularının Kirliliği; Termal Suların Kirliliği
-Yüzeysel Su Kirliliği: Deniz Kirliliği; Göl, Gölet, Baraj Gölü Kirliliği; Akarsu Kirliliği
-Yağış Suları Kirliliği.
2. Suyun Kullanım Durumuna Göre Kirliliği:
-İçme Kullanma Suyunun Kirliliği
-Diğer Suların Kirliliği
3. Nedenlerine Göre Su Kirliliği:
-Doğal Nedenler Sebebiyle Oluşan Su Kirliliği
-İnsani Faaliyetler Sebebiyle Oluşan Su Kirliliği: Evsel Kirlenme, Endüstriyel Kirlenme, Tarımsal Kirlenme, Isıl Kirlenme.
4. Kirleticilerin Suda Görülebilmesine Göre:
-Makroskobik Su Kirliliği
-Mikroskobik Su Kirliliği.
5. Kirletici Etkenlere Göre Su Kirliliği:
-Mikrobiyolojik Kirlilik
-Organik Maddelerden Kaynaklanan Kirlenme
-Radyoaktif Kirlilik
-Kimyasal Kirlilik: Endüstri Atıkları; Sentetik Deterjanlar; Pestisitler; Yapay ve Doğal Organik ve İnorganik Kimyasal Maddeler; Yapay ve Doğal Tarımsal Gübreler.
-Isıl Kirlenme
-Kombine atıklarla meydana gelen kirlenme.
6. İçme - Kullanma Sularının Kirlendiği Yere Göre Su Kirliliği:
-Suyun Kaynağında Kirlenmesi
-Suyun Kirlilik Gideriminde Sorun Olması
-Su Dağıtım Sisteminden Kaynaklanan Kirlilik: Şebeke Sistemlerinden Kaynaklanan Kirlilik; Şebeke Yetersizlik ve Hasarları; Geri Emilim
-Bina İçi Su Yapılarından Kaynaklanan Kirlilik.