İSGÜM aşağıdaki birimlerden oluşmaktadır:
• Kalite Bölümü,
• İş Sağlığı ve Meslek
Hastalıkları Bölümü,
• İş Hijyeni Bölümü,
• Laboratuvar Yetkilendirme Bölümü,
• Kontrol Belgesi Bölümü,
• Eğitim ve Organizasyon Bölümü,
• Uluslararası İşbirlikleri,
• Proje ve Strateji Bölümü,
• KKD Bölümü,
• İş Güvenliği Bölümü.