İşletim sisteminin önyükleme dosyaları arasına sızarak bilgisayarın açılmasıyla birlikte çalışmaya başlayan önyükleme bölümü (boot sector) virüsleri, Polyboot.B ve AntiEXE gibi türleri olan virüslerdir. Bu virüs, her açılışta hafızaya yüklenmeyi garantilemek amacıyla kodlarını ön yükleme sektörüne yerleştirir. Disket kullanımı yerine, CD-ROM’ların kullanılmaya başlanması ve CD-ROM içerisindeki bilgilerin değiştirilemez ve kod eklenemez olmasından ötürü, bu tür virüslerin yayılımı azalmıştır.