Windows işletim sistemleri son kullanıcıya daha yakın ve gelişmiş arayüzü desteğine sahiptir. Linux işletim sisteminde ise bazı işlemleri gerçekleştirmek için uzmanlık gerekebilir. Ticari firmaların ürettiği yazılımlar genellikle Windows veya Mac OS içindir. Windows işletim sisteminde kullandığımız her programın eş değerini Linux işletim sisteminde  bulamayabiliriz veya bulsak bile Windows’taki gibi kullanımı kolay olmayabilir. Windows işletim sistemlerinin yıllardır pazarda lider olmasından dolayı oyun programlarının çoğu Windows için geliştirilmiştir. Birçok oyun programı Linux işletim sistemlerinde çalışmamaktadır.