Microsoft Windows işletim sisteminin 3.x, 95, 98 ve ME sürümleri MS-DOS üzerine çalışan grafiksel uygulamalar olarak tasarlanmıştır. NT sürümüyle birlikte yeni çekirdekler üretilmiş ve MS-DOS Windows işletim sisteminin bir parçası olmaktan çıkarılmıştır. Bundan sonraki Windows sürümlerinde sadece DOS programlarının yürütülebilmesi için özellikleri azaltılmış versiyonları barındırılmıştır.