F-M analizi özellikle 1930’lu yıllardan itibaren
önem kazanmıştır. F-M analizi ilk olarak ABD’de sulama alanında 1936 tarihli “Taşkın Önleme Yasası” ile uygulanmıştır. Ancak Yasa, analizde fayda ve maliyetlerin değerlendirilmesine önemli yenilik getirememiştir. Bundan sonra 1937 yılında Oregon eyaletinde karayolu projesinde F-M analizi uygulanmıştır. Fayda-maliyet analizi gerçek anlamda ancak 1950’li yıllardan sonra uygulama imkanı bulmuştur. Bu yıldan itibaren ABD dışında bazı ülkelerde de F-M analizi konusunda yoğun çalışmalar sürdürülmüştür. İngiltere’de ilk önemli uygulama 1969 yılında Londra-Birmingham karayolu çalışmasında (M1 karayolu) yapılmıştır. Daha sonra 1963 yılında Londra metrosuna Victory hattının eklenmesi çalışmasında F-M analizi uygulanmıştır. İngiltere’den sonra F-M analizi Fransa ve Sovyetler Birliği’nde uygulanmaya başlanmıştır. Ülkemizde ise Fayda-Maliyet analizi konusunda ilk ciddi çalışma planlı dönemle (1960) başlamıştır.