BSA’ların tanımlanması, kimliklendirilmesi ve sınıflandırılması; tanı konulmasında, tıbbi önlemlerin alınmasında (proflaksi) ve tedavi yöntemlerinin belirlenmesinde önemli bir yer tutar. Bu durumda BSA’lar kaynaklarına göre:
1. Bakteriler,
2. Virüsler,
3. Biyolojik Toksinler
olmak üzere başlıca üç gruba ayrılabilir. Bu sınıflandırmanın dışında yer alan riketsiyalar, klamidyalar ve mantarlar da BSA olarak kullanılabilmektedirler.