Proton sayıları aynı nötron sayıları farklı olan bir elementin nüklitleri, o elementin izotopları olarak adlandırılır. Örneğin, hidrojenin üç izotopu vardır. Bunlar; hidrojen-1 (çekirdeğinde 1 proton olan, yaygın olarak bilinen hidrojen), döteryum olarak adlandırılan hidrojen-2 (bir proton ve bir nötronu vardır) ve trityum olarak adlandırılan hidrojen-3’tür (bir proton ve iki nötronu vardır).