Hanlığın başkenti başta Kırım şehri, daha sonra Bahçesaray şehri idi. Eskiden beri bölgede var olan Cenevizlilerin bu kavgalara müdahalesi ile Büyük Orda Hanı Seyit Ahmed’in aynı sırada Kırım’a askerî seferler düzenlemesi, kuruluş aşamasını yeni tamamlayan hanlığı son derece zor durumda bıraktı. Bunun üzerine hanlıkta güçlü bir konuma sahip olan Şirin kabilesinin Beyi Eminek Mirza Osmanlı Devleti’nden yardım istedi. Osmanlı Rusya ile tekrar mücadeleye girişse de (1787-1792) yarımada geri alınamadığı gibi Kırım Hanlığı bu mücadelenin sonunda Rusya tarafından ilhak edildi.