Yıldırım Bayezid, ünlü Batı Anadolu seferiyle bu beyliğe de son vermiştir (1390). Ankara Savaşı’ndan sonra hakimiyetini tanıması kaydı ile Timur, Mehmed Bey oğlu İlyas’a, Menteşe ilini geri verir (1403). Saruhan ve Aydın oğulları ile birlikte Çelebi Mehmed’e karşı mücadele veren İlyas Bey, müttefiklerinin yenilmesi üzerine Çelebi Mehmed’e itaat eder (1405). Menteşeoğlu İlyas Bey’in ölümünden sonra, Osmanlı sarayında rehin tutulan iki oğlu kaçıp, Menteşe iline gelmişlerdi. Ancak II. Murad, bu iki kardeşi yakalatmış ve Menteşe Beyliğini ortadan kaldırmıştır (1424).