Akarsu, göl ve denizler gibi çeşitli su ortamlarının ve ayrıca içme sularının farklı etkenlerle, insan başta olmak üzere diğer canlıların yaşamını olumsuz yönde etkileyecek biçimde bozulması sonucu su kirliliği oluşur. Sanayi ve evsel kaynaklı organik, inorganik, biyolojik veya radyoaktif atıkların sulara karışması, büyük ölçekli baraj projeleri, suların akış yönünün değiştirilmesi, kurutma ve ıslah çalışmaları, aşırı ve yasadışı balıkçılık, bilinçsiz avlanma, sazlık alanlarının yakılması ve turizm etkinliklerinden kaynaklanan baskı, su kaynaklarına ve su ortamındaki yaşama büyük zararlar vermekte ve suyun kalitesini ölçülebilecek nispette bozmaktadır.