Ekip çalışmasının birçok avantajı olmasına rağmen ekibin bir araya getirilmesinde ve yürütülmesinde bazı güçlüklerle karşılaşılmaktadır. Bunlar; • Ekip üyelerinin tümünü aynı zamanda ve aynı yerde bir araya getirme, • Amaca yönelik olarak ortak noktayı yakalama ve güçlü ekip anlayışının sürdürülmesi, • Kişilerarası gereksinimleri ele alma, • Liderlik çatışmaları, • Mekan ve zaman düzenlemesi, • İletişim, • Çatışma, • Ben odaklı davranışla baş edememe, • Gerçekçi olmayan çalışma beklentileri, • Ekip üyeleri arasında kabul ve saygı şeklindedir.