Zaman temeline dayalı ücret sisteminin dezavantajları ise şu şekilde sıralanabilir:
• İşçilere ödenecek ücret ile yapılan iş arasında doğrudan ilişki kurulamadığından  çalışanları motive etmez.
• İşçilerin sürekli biçimde gözetimine ve kontrolüne gereksinim duyulur.
• Hizmet başına düşen birim işçilik maliyetleri verim düştüğünde artar.
• İşçilerin bilgi, beceri ve yetenek düzeyleri göz ardı edilerek ücret hesaplandığından  iş ortamındaki huzuru bozabilir.