Katman maskeleri bulundukları katmana eklenebilen maskeleme katmanlarıdır. Layer>Add Layer Mask  seçeneği ya da katman paleti üzerindeki ilgili düğmeden oluşturulurlar. Bulundukları katmandaki piksel gruplarının görünürlüklerini etkilerler. Koyu bölgeler kapatıcı, beyaz bölgeler de görünürlük sağlar. Bunlara vektör maskeleri adı verilir.