NodeXL programında çizge çizildikten sonra, “Groups” kısmından “Group by cluster” (kümelere göre grupla), kullanılacak algoritma seçimi ile uygulanır ve “Refresh Graph” (çizgeyi yenile)’e tıklanır. Elde edilen çizgeye ait verilerin bulunduğu çalışma sayfasında “Group Vertices” tıklandığında hangi düğümün hangi grupta yer aldığı görülebilir.