Doku kültürü laboratuvarı kurulmasında en fazla önem verilmesi gereken konu sterilitedir. Kontaminasyondan kaynaklanan kayıplar ekonomik açıdan çok önemlidir. Bu kayıpların oranı %1 ile %50 arasında değişiklik gösterebilir. Rutin temizlik ve aseptik işlemler bu kayıpları %1 den daha az oranlara kadar azaltabilir.