Uygulama kolaylığı sağlamak amacıyla, bazen, ilaçların sınıflandırılmaları gerekir. Bu sınıflandırma, ilaçların kimyasal yapılarındaki benzerlik esas alınarak yapılabilir. Örneğin, ortak kimyasal yapıları ile ilişkili olarak, kimyasal iskeletlerinde sülfonilüre yapısı taşıyan ilaçları “sülfonilüreler”, salisilik asit taşıyan ilaçları ise “salisilatlar” adı altında sınıflandırırız. İlaçlar, vücutta etkilenen yapının (sistemin, organ vs) temel alındığı bir yaklaşıma göre yani etki yörelerine göre de sınıflandırılabilirler. Örneğin, kalp kasını etkileyerek kalbin kasılma gücünü artıran bazı ilaçlar “kalp glikozitleri” olarak sınıflandırılır. Sınıflandırma bazen de kullanım amaçlarına göre yapılır. Örneğin, depresif bozuklukların tedavisinde kullanılan ilaçlar “antidepresan ilaçlar”, ağrı kesmek için kullanılan ilaçlar ise “analjezikler” olarak sınıflandırılır. İlaçlar, elde edildikleri kaynaklara göre sentetik, doğal ya da yarı-sentetik olarak da sınıflandırılabilirler. Tedavinin vazgeçilmez öğesi olan ilaçların büyük kısmı kimyasal sentez yolu ile elde edilir. Diğer bir ifade ile ilaçların önemli bir bölümü “sentetik” kaynaklıdır. Hazırlanış şekillerine göre ofisinal ilaç, majistral ilaç ve müstahzar ilaç olmak üzere üç sınıfa ayrılırlar.