Mahkemenin yargı yetkisine giren suçlar: Cenevre Sözleşmesi’nin ağır ihlalleri, savaş ve savaş örf-adet hukukuna aykırılık, soykırım suçu ve insanlığa karşı işlenen suçlardır. Mahkeme bu suçlar için ceza-i sorumluluğun bireyselliği ilkesini benimsemiştir. Yani Mahkeme sadece gerçek kişileri yargılayabilmektedir. Bu kapsamda gruplar ve organizasyonlar Eski Yugoslavya Uluslararası Ceza Mahkemesinin kapsamı dışında kalmıştır.