Sürü sağlığı programlarının başarısızlık sebeplerinden bazıları şöyle sıralanabilir:

• Veteriner Hekimlerin bilgi ve motivasyonlarının üreticilerin (ya da işletmecilerin) beklentilerini karşılayamaması (ya da tam tersi).

• Veteriner Hekimlerin acil durumlar dışında, düzenli yapılması gereken kontrol ve değerlendirme amaçlı çiftlik ziyaretlerini gerçekleştirmemeleri. 

• Sürü sağlığı ve yönetimi konusunda en sık yapılan hata, aşılama gibi tek bir unsur üzerinde durulmasıdır.
• • Veteriner Hekimler ve üreticiler arasındaki iletişimsizlik.
• • Gereğinden fazla önerilerle üreticilerin yıldırılması.
• • Önerilerin çiftlik personelince uygulanmaması.
• • Sonuçların analizinin ve yapılan uygulamaların değerlendirilmesindeki hatalar.
• • Veteriner Hekimlik ücretlerinin yüksek bulunması.