Aminoasitlerin amfoter özellikleri karboksil gruplarının proton verebilmesi, buna karşın amino gruplarının proton alabilmesi sayesinde mümkün olabilmektedir. Alkalik ortamda -COOH grupları H iyonlarını verir ve negatif yüklü -COO- haline dönüşür (COO- ve H). Asit ortamda -NH2 grupları H iyonlarını alır ve pozitif yüklü -NH3 + gruplarına değişir. İEN (izoelektrik nokta)’da ise H iyonu -COOH grubundan NH2 grubuna geçer. Böylece aminoasit molekülünde negatif yük taşıyan bir -COO- grubu ve pozitif yüklü bir NH3 + grubu aynı anda bulunur. Buna Zwitterion denir