İlaç kalıntılarının ekonomik ve sağlık olmak üzere iki yönlü olumsuz etkileri vardır

Penisilin ve benzeri antibiyotiklerin kalıntılarının süt ürünlerindeki yararlı bakterileri/mayaları öldürüp bozulmasına neden olması ekonomik zarara örnektir

İlaç kalıntılarının güvenlik yönünden etkileri doğrudan-kısa sürede ve dolaylı yoldan-uzun sürede olmak üzere iki şekilde değerlendirilir

Dolaylı yoldan-uzun sürede etkiler hayvan sağaltımında kullanılan ilaçların dokularda oluşturduğu kalıntıların ürünlerle alınması neticesinde insanlarda görülen aşırı duyarlılık reaksiyonlarını ifade eder

Hormon kalıntılarına uzun süreli maruziyet cinsiyet karekterlerinde değişikliğe, antibiyotik ve antelmentik kalıntılı ürünlerin uzun süre tüketilmesi ise bakteri ve parazitlerde direnç gelişimi ile kontrol edilemeyen hastalık salgınlarına yol açar