Parazitoloji başlıca üçe ayrılır: Protozooloji, Protozoa’ları yani tek hücreli parazitleri; Helmintoloji, parazit solucanları; Artropodoloji ise eklembacaklı parazitleri inceler. Bunların dışında Filogenetik, çeşitli organizma grupları arasındaki evrimsel ilişkiyi araştırırken; Şemoterapotik (kemoterapötik) ise enfeksiyon hastalıklarının tedavisinde kullanılan maddeleri konu edinen bilim dallarıdır.