Konjugasyon üreme şekli iki protozoon arasında pronükleusların değişimi ile gelişen zigot çekirdeğinin oluşumu ile birleşmenin tamamlandığı bir çoğalma şeklidir. Konjugasyon aynı tür iki protozoonun uzun süre ayrı ayrı bölünerek çoğalması sonucu oluşan dejenerasyonu hücreler arasında çekirdek alış verişi sayesinde engeller. Konjugasyonda aynı türün iki ferdi uzun eksenleri boyunca karşı karşıya gelirler. Birbirlerine temas ettikleri noktada zarın erimesiyle iki protozoon arasında bir köprü kurulur. Makronükleusları resorbe edilen protozoonlarda mikronukleuslar iki kez bölünerek dörder adet mikronükleus oluşur. Bunlardan üçer tanesi resorbe edilir. Kalan nükleus tekrar ikiye bölünür ve oluşan nükleuslara pronükleus adı verilir. Bunlardan biri kalıcı diğeri gezici pronükleusdur. Her iki bireyin gezici pronükleusları yer değiştirerek kalıcı pronükleuslar ile birleşir. Daha sonra protozoonlar ayrılır, döllenmiş çekirdek üç kere arka arkaya bölünerek sekiz çekirdek oluşur ve bir mikronükleus bir makronükleus olmak üzere eşleşirler. Daha sonra sitoplazma da bölünür ve bir protozoondan dört adet yeni protozoon meydana gelmiş olur.