Vücudun bağışıklığının kaybolmasıyla kendine karşı belirli bölgelerde otoantikorlar ve bağışık yanıt oluşmasıyla meydana gelen hastalıklara otoimmun hastalıklar denir. Otoimmun hastalıkların nedeni henüz tam olarak bilinmemektedir. Bir virüs enfeksiyonu sırasında ya da bazı ilaçlarla sağaltımdan sonra ya da yaşlanma sonucu meydana gelebilir. Hastalık oluşturan bileşen bazen yaygın olur ve belirtiler yaygın şekilde ortaya çıkar. Bazen de bir veya birkaç organda yerleşir ve sadece bunlarda birincil bozukluk olur.. Otoimmun hastalıkların oluşmasında genetik yatkınlığın da katkısı vardır.