Faz Kontrast mikroskop, boyanmamış canlı hücre ve doku kesitlerinin incelenmesine olanak sağlar. Boyanmamış örneklerin tüm kısımları hemen hemen aynı optik yoğunluğa sahip olduğundan ayrıntılı olarak gözlenmeleri güçtür. Faz kontrast mikroskobu geçirgen nesnede seçilebilir görüntüler elde edebilen mercek sistemine sahiptir. Temel ilkesi ışığın farklı kırılmaya sahip hücre ve hücre dışı yapılardan geçerken hız ve yönünü değiştirmesine bağlıdır. Bu değişiklikler yapıların daha açık veya koyu görünmesine neden olur. Özellikle doku kültürü gibi canlı hücresel yapıların gözlenmesinde kullanılırlar.