Ekzojen antijenler, herhangi bir şekilde vücuda dışardan alındığında immun yanıt oluşturan antijenlerdir. Mikroorganizmalar, çiçek polenleri ve bazı toksinler sıklıkla rastlanılan bu grup immunojenlerdir. Endojen antijenler; normal olarak veya herhangi bir nedenden dolayı organizmada şekillenen antijenlerdir.