Kurulduğu dönemde Türkiye tarafından çok da ciddiye alınmayan AET, Türkiye ile Yunanistan ilişkilerindeki yoğun gerginlik ve hatta çatışmaların bir ürünü olarak Türkiye’nin gündemine girmiştir. Yunanistan’ın AET ile ortaklık anlaşması yapmak için 8 Haziran 1959’da yaptığı başvurudan sadece üç hafta sonra, 31 Temmuz 1959’da Türkiye’de tıpkı Yunanistan gibi örgüte ortaklık için başvuruda bulunmuştur. Dönemin Dışişleri Bakanı Zorlu’nun “Yunanistan nereye başvursa biz de başvurmalıyız çünkü Yunanistan tek başına bırakılacak bir ülke değil. İsterse boş havuza atlasınlar, biz de atlamalıyız” dediği rivayet edilmektedir. 1950’nin başından itibaren başlayan ve her geçen gün daha da artan Türkiye-Yunanistan rekabetinin bu süreçte çok önemli yeri olduğu bilinmektedir.