Yugoslavya Sosyalist Cumhuriyeti’nden ilk ayrılan devlet Slovenya olmuştur. Bunu Hırvatistan, Makedonya ve ardından Bosna-Hersek takip etmiştir. Slovenya’nın güçlü ve düzenli bir orduya sahip olması Yugoslav ordusuyla yaşanan çatışmalarda etkisini göstermiş ve Belgrad yönetimi bu ülkenin bağımsızlığını tanımak zorunda kalmıştır. Ancak Hırvatistan’ın bağımsızlık ilanı, Sırplar ile Hırvatlar arasında bir iç savaşın çıkmasına neden olmuştur. Federal ordu bu savaşta Sırp tarafında yer almıştır. Ancak Hırvatlara Almanlar başta olmak üzere dış dünyadan gelen destek, Hırvatistan’ın bağımsızlığını kazanmasında önemli etkiye sahiptir. Bosna-Hersek’te ise bütün tehdit ve tedhişe rağmen, 29 şubat 1992’de gerçekleştirilen referandumda halkın yüzde 99’u bağımsızlık yönünde oy kullanmış ve Bosna-Hersek de bağımsızlığını ilan etmiştir.