Depoların iyi çalıştırılmasının en önemli önkoşulu sistemin performansının doğru bir biçimde ölçülebilmesidir. Herhangi bir deponun fiziksel yerleşimi gerçekleştikten sonra yapılması gereken ilk çalışma bir performans ölçüm sisteminin (performance management system) tesis edilmesidir. Bu anlamda kullanılan Geleneksel Performans Tablosu, Finansal Performans, Verimlilik Performansı, Kalite Bazlı Performans Ölçütleri, Çevrim Süresi (Cycle Time) Performans Ölçütleri, Depo değerlendirmesi gibi çeşitli yöntemler vardır.