Görevli mahkemeyi, ödeme emrine konu edilen alacağın türüne göre tayin etmek gerekir.

Genel bütçeye, il özel idareleri, belediye ve köylere ait vergi, resim ve harçlar ile benzeri mali yükümler ve bunların zam ve cezaları ile tarifelere ilişkin davalar vergi mahkemesinin; bunun dışındaki davalar ise idare mahkemesinin görev alanına girer.

Ödeme emrine karşı tebliğ tarihinden itibaren yedi gün içinde dava açılabilir. Bu süre hak düşürücü niteliktedir.

Borçlunun ödeme emri nedeniyle üst idari makamlara başvurması yedi günlük süreyi durdurur.

Ödeme emrinde, kamu alacağının ödenmesi için yedi günden fazla (örneğin otuz gün) süre yazılmış olması yedi günlük dava açma süresini uzatmaz.