İdari Yargılama Usulü Kanunu ve Hukuk Muhakemeleri Kanunu’na atıfta bulunulan hâller saklı kalmak üzere, vergi uyuşmazlıklarının çözümünde, Vergi Usul Kanunu’nun ilgili hükümleri uygulanır (İYUK.m.31/2). Nitekim, Vergi Usul Kanunu’nun bazı maddeleri vergi yargılaması usûlü ile ilgili önemli hususları düzenlemektedir. Bunlar, Vergi Usul Kanunu’nun vergi yargılaması usulünde delil ve isbatla ilgili 3’üncü; dava açmaya yetkili kişilerle ilgili 377’nci; davanın konusuyla ilgili 378’inci ve vergi davalarında duruşmalara kimlerin katılabileceğini belirleyen mükerrer 378’inci maddesindeki düzenlemelerdir.