İlk değerlendirmede kullanıcı fonksiyonlarının genel yapısı saklı yordamlara benzemekle beraber aralarında aşağıdaki farklar vardır:

• Kullanıcı tanımlı fonksiyonların içerisinde herhangi bir yerde WHERE/HAVING/SELECT vb. kullanılabilirken saklı yordam kullanılamaz. Ayrıca saklı yordamda fonksiyonlar çağrılabilirken, fonksiyon içinde saklı yordam çağrılamaz.
• Kullanıcı tanımlı fonksiyon mutlaka bir tablo veya sayılı değer döndürmelidir. Döndürdüğü tablo değeri, diğer tablolar ile JOIN vb. işlemler yapmak için kullanılabilir. Saklı yordamların mutlaka değer döndürmeleri gerekmez.
• Saklı yordamlarda veri işleme (INSERT/UPDATE/DELETE) komutları çalıştırılabilirken kullanıcı fonksiyonlarında bu işlemler yapılamaz.
• Saklı yordam içinde bölüm ikide anlatılan TRY CATCH yapısı ile hata ayıklama opsiyonu varken, fonksiyonlar içinde bu opsiyon yoktur.
• Saklı yordam içinde ileriki bölümlerde anlatılan hareket yönetimi varken, fonksiyon içinde bu mümkün değildir.
• Saklı yordamlar derlenmiş olarak veritabanında tutulurken, fonksiyonlar çalışma zamanında derlenir ve çalıştırılır.