Biyolojik indikatörle yapılan kontroller otoklavın sterilizasyon etkinliğini değerlendirir. Biyolojik indikatör olarak ısıya dirençli sporları olan Bacillus stearothermophilus standart suşları kullanılır. Kağıt şeritlere inoküle edilmiş biyolojik indikatör sporlar sterilizasyon işleminden sonra uygun bir inkübasyon dönemi içerisinde üremezlerse sterilizasyonun yeterli olduğunu gösterir.