Normal bağırsak flora etkeni olan E.coli’ler dışkı ile saçılmak suretiyle çevreye,yemlere ve sulara bulaşmaktadır. E.coli’nin bulaşması fekal-oral yol (dışkı-ağız) ile olmaktadır. Genelde bağırsaktaki E.coli sayısı iki biyolojik faktör ile kontrol altında tutulmaktadır. Bunlardan biri bağırsakta bulunan diğer bakteriler ile E.coli’ler arasındaki kompetitif antagonizmadır. Diğeri ise yeni doğanlarda kolostrum ve süt ile alınan antikorların sağladığı lokal bağışıklıktır.