Filezilla aşağıdaki özelliklere sahiptir:
• FTP, FTP dışında SSL/TLS (FTPS) ve SSH dosya transfer protokolü (SFTP)
• IPv6 desteği
• 4 GB’den büyük dosyaların transferinde kaldığı yerden devam edebilme özelliği
• Sekmeli kullanıcı arayüzü
• Yer imleri
• Sürükle bırak desteği
• Ayarlanabilir dosya transfer hızı
• Dosya adlarına göre filtreleme
• Dizin karşılaştırma
• Ağ ayarları sihirbazı
• Uzak dosya düzenleme özelliği
• HTTP/1.1, SOCKS5 ve FTP-Proxy desteği
• Dosya günlükleri
• Uzak dosya arama özelliği